徐美东教授是国内最早开展ESD治疗消化道早癌及癌前病变、POEM治疗贲门失弛缓症的专家之一，是我国乃至世界消化内镜切除技术迅速发展的推动者和引领者之一。除精通ESD、POEM以及STER等最新内镜技术外，还擅长ERCP治疗各种胆胰系统疾病，硬化剂及套扎治疗食管胃底静脉曲张，超声内镜诊断与介入治疗各种消化道疑难疾病，尤其是对内镜下扩张及支架治疗各种难治性消化道良恶性狭窄梗阻有独到造诣。在工作中重视技术创新与改良，并用以解决遇到的困难与问题，极大提高了内镜手术的安全性与便利性。
在国内率先开展了多项内镜诊疗新技术：如第一例急性完全性大肠梗阻的导管和支架治疗；第一例经鼻胃镜置管和支架术；第一例超声胃镜引导下胃空肠吻合术等新技术。其中“可回收金属支架治疗难治性消化道良性狭窄”与 “内镜下置管与金属支架治疗急性结直肠梗阻”因采用个体化全覆膜金属支架等方法治疗难治性消化道良性狭窄，以及在国内创新性地使用肠梗阻导管和内镜支架治疗完全性大肠梗阻、避免肠梗阻病人行腹部造瘘二次手术于2008年获得2项上海市优秀发明奖铜奖及“恩德斯医学科学技术奖——杰出成就奖"。
2011年在国际上首创STER（内镜经黏膜下隧道肿瘤切除术）治疗各种消化道黏膜下肿瘤，该术式极大地提高了内镜切除手术的安全性，并被ASGE（美国胃肠内镜学会）作为治疗黏膜下肿瘤的标准安全手术方式写入治疗指南。多次应邀出席参加美国、意大利、西班牙、德国、荷兰、希腊、印度等世界各地举办的国际消化内镜学术大会，通过大会主题演讲及手术操作演示，在世界各地推广该技术。目前STER已经被国内外同行广泛接受并称之为“徐氏手术”，常规应用于临床，是世界内镜界为数不多由华人医师发明并被写入指南的手术。徐美东教授因STER获得2013年上海市优秀发明奖银奖、2014年首届中山医院新技术推广奖一等奖。以“荷包缝合”为主体的内镜缝合技术因解决了长期困扰内镜治疗的“穿孔”问题而获得2015年中山医院新技术推广奖二等奖。
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